Bidang penelitian di laboratorium bioteknologi lingkungan yang mendukung kegiatan pembelajaran serta pengabdian kepada masyarakat dilakukan sesuai dengan skema yang tersaji pada gambar berikut:
Berdasarkan bidang-bidang tersebut, topik penelitian yang dilakukan di laboratorium bioteknologi lingkungan dijelaskan secara terperinci sebagai berikut: